為使我院的保密工作做到有章可循，走上制度化、規(guī)范化的管理軌道，自1984年以來(lái)，我院共制定了20幾項(xiàng)保密規(guī)章制度，其中科技方面的有科技保密規(guī)定、科技保密管理規(guī)定、公布宣傳報(bào)道科技技術(shù)文稿保密審查暫行規(guī)定、出國(guó)科技論文、學(xué)術(shù)報(bào)告保密制度審查規(guī)定、涉外科技展覽、技術(shù)出口項(xiàng)目審查辦法等。
　　由于我院是一所多學(xué)科、多專業(yè)綜合性的地方農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu)，擁有較多的科研成果和內(nèi)部科技秘密，它們是科研人員勞動(dòng)和智慧的結(jié)晶，凝聚了科研人員的心血。雖然，我院涉及國(guó)家秘密的事項(xiàng)不是很多，但保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)、嚴(yán)防科技成果流失任務(wù)很艱巨，特別是人作為科技載體，僅靠加強(qiáng)思想教育是不夠的。因而制定、完善相應(yīng)的制度，采取有效的措施，防止科技成果流失，擺到了議事日程。為此，1994年我院制定了《北京市農(nóng)林科學(xué)院關(guān)于防止科研成果外流的暫行規(guī)定》這個(gè)規(guī)定首先明確了我院的科技成果范圍和處罰辦法，即科技成果范圍包括國(guó)家批準(zhǔn)的發(fā)明專利項(xiàng)目；品種的親本；疫苗、農(nóng)藥和肥料的配方；果樹(shù)、花卉、苗木和畜禽的原原種；屬于特有的品種資源、技術(shù)決竅；其它各類與科技成果相關(guān)的試驗(yàn)技術(shù)、數(shù)據(jù)、材料。對(duì)造成科技成果流失、泄露科技秘密的個(gè)人，不管其是否得利，均可視情節(jié)給予以下1項(xiàng)或多項(xiàng)處罰。
　　1．取消年度獎(jiǎng)金、咨詢費(fèi)分配資格；
　　2．取消1次分房資格；
　　3．減報(bào)或停報(bào)醫(yī)療費(fèi)；
　　4．取消l——2次技術(shù)職務(wù)晉升資格，直至降低或取消技術(shù)職務(wù)；
　　5．取消1—2次工資晉級(jí)資格，直至降低或取消工資；
　　6．免除行政職務(wù)；
　　7．解聘或開(kāi)除公職。
　　對(duì)擅自轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)技術(shù)成果非法得利的，沒(méi)收其全部所得，并處其所得1——2倍的罰款。
　　1997年為進(jìn)一步加強(qiáng)科研成果、技術(shù)的管理力度，我院紀(jì)檢委與監(jiān)審處聯(lián)合制發(fā)了《北京市農(nóng)林科學(xué)院關(guān)于依法保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)。嚴(yán)防科技成果流失的通知》，將這項(xiàng)工作納入法制管理的軌道。在此通知中，不僅重申了院紀(jì)委、監(jiān)察處是科技保密工作的監(jiān)督檢查部門，而且要圍繞保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)法律、法規(guī)及我院關(guān)于防止科學(xué)研究成果流失的規(guī)定的落實(shí)，加大監(jiān)察執(zhí)法力度，對(duì)黨員、干部嚴(yán)格要求，嚴(yán)格管理，嚴(yán)格監(jiān)督。同時(shí)，根據(jù)工作需要到各單位巡視，了解科技保密工作的貫徹執(zhí)行情況。發(fā)現(xiàn)問(wèn)題首先對(duì)有關(guān)責(zé)任人進(jìn)行調(diào)查核實(shí)，需要立案的，按有關(guān)規(guī)定報(bào)批，對(duì)嚴(yán)重違法違紀(jì)的，不管涉及到誰(shuí)，都要一查到底，對(duì)造成科研成果流失的，依法給予黨紀(jì)、政紀(jì)處分，構(gòu)成犯罪的，依法追究刑事責(zé)任。
　　各研究所還根據(jù)本所情況，相應(yīng)制定了本所的制度。例如：我院的蔬菜研究中心，針對(duì)本所與國(guó)內(nèi)外的交流頻繁，人員互訪、合作研究多的情況，制訂了蔬菜研究中心保密工作規(guī)章制度，其中主要有《蔬菜研究中心保密工作管理辦法》k蔬菜新品種成果保密條例》、《北京市蔬菜種質(zhì)改良實(shí)驗(yàn)室科學(xué)技術(shù)保密規(guī)定》。
　　在《蔬菜研究中心保密工作管理辦法》中明確規(guī)定各課題上報(bào)、轉(zhuǎn)讓科研成果、申報(bào)專利均需報(bào)本單位領(lǐng)導(dǎo)審批。在上報(bào)前，課題主持人應(yīng)對(duì)本課題檔案劃分密級(jí)提出對(duì)內(nèi)對(duì)外保密范圍措施，科技人員及其他人員在調(diào)離本單位及退休前，應(yīng)將從事專業(yè)全部材料移交、歸檔。科技人員在流動(dòng)中不得將本人在工作中掌握的，由本單位擁有的技術(shù)秘密非法披露給用人單位，轉(zhuǎn)讓給第三者或者自行使用。
　　在《蔬菜新品種成果保密條例》中對(duì)蔬菜新品種成果的權(quán)益、蔬菜新品種成果及其轉(zhuǎn)讓與開(kāi)發(fā)中的保密內(nèi)容都作了詳細(xì)具體的規(guī)定。例如：蔬菜品種的原始材料、中間材料、親本以及育種程序、數(shù)據(jù)資料、蔬菜新品種的繁育基地的地點(diǎn)、繁種的品種與數(shù)量、基地聯(lián)系人；蔬菜新品種開(kāi)發(fā)、銷售策略計(jì)劃、種子經(jīng)零價(jià)格的安排；蔬菜新品種包裝版面（包括品種照像底片）均屬保密內(nèi)容；參與蔬菜新品種成果的開(kāi)發(fā)人員，不得私自留用親本或生產(chǎn)用種。原則上，親本或原原種由主持人或有關(guān)負(fù)責(zé)人掌握，無(wú)關(guān)人員不得參與親本的制種與保管工作；蔬菜新品種制種過(guò)程中，親本或原原種要嚴(yán)格按需要發(fā)放，并及時(shí)收回多余的親本或原原種，嚴(yán)防制種單位或個(gè)人私自留用或挪作它用。
　　在《北京市蔬菜種質(zhì)改良實(shí)驗(yàn)室科學(xué)技術(shù)保密規(guī)定》中要求，凡進(jìn)人實(shí)驗(yàn)室的工作人員，一律先進(jìn)行保密知識(shí)教育，并與實(shí)驗(yàn)室簽訂聘任合同和保密責(zé)任書。凡是實(shí)驗(yàn)室的正式人員一律不準(zhǔn)業(yè)余兼職，也不準(zhǔn)從事與本技術(shù)領(lǐng)域有關(guān)的技術(shù)和經(jīng)濟(jì)的咨詢和服務(wù)。保密項(xiàng)目的檔案，應(yīng)準(zhǔn)確地標(biāo)明密級(jí)，并堅(jiān)持專人專柜管理。項(xiàng)目研究的技術(shù)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果必須記錄在實(shí)驗(yàn)室特定設(shè)置的記錄本上。實(shí)驗(yàn)記錄本要按順序編號(hào)，每本要編頁(yè)碼，不得撕頁(yè)，實(shí)驗(yàn)記錄本用完用交保密員歸檔保存。客座及外聘人員在與實(shí)驗(yàn)室簽訂工作合同時(shí)要同時(shí)簽訂保密協(xié)議，遵守實(shí)驗(yàn)室的保密規(guī)定，對(duì)發(fā)表文章和申報(bào)成果承擔(dān)保密責(zé)任。對(duì)于合作研究，要在協(xié)議中明確保密范圍、時(shí)間及知識(shí)產(chǎn)權(quán)的隸屬關(guān)系。